Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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PTCH1Q13635 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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PTCH1Q13635 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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PTCH1Q13635 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTCH1Q13635 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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