Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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