Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEUROD1Q13562 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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