Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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SQSTM1Q13501 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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SQSTM1Q13501 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQSTM1Q13501 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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