Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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