Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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CHAF1BQ13112 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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CHAF1BQ13112 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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CHAF1BQ13112 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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CHAF1BQ13112 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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CHAF1BQ13112 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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CHAF1BQ13112 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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CHAF1BQ13112 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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CHAF1BQ13112 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
CHAF1BQ13112 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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