Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1AQ13111 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1AQ13111 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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