Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
GPS1Q13098 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPS1Q13098 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms