Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PRDM2Q13029 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms