Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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CASQ1P31415 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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CASQ1P31415 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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CASQ1P31415 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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CASQ1P31415 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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CASQ1P31415 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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CASQ1P31415 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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CASQ1P31415 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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CASQ1P31415 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CASQ1P31415 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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