Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NMBRP28336 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NMBRP28336 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NMBRP28336 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NMBRP28336 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NMBRP28336 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NMBRP28336 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NMBRP28336 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NMBRP28336 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NMBRP28336 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NMBRP28336 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NMBRP28336 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NMBRP28336 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NMBRP28336 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NMBRP28336 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms