Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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IRGMA1A4Y4 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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IRGMA1A4Y4 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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IRGMA1A4Y4 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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IRGMA1A4Y4 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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