Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms