Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms