Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP21Q9UK80 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
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