Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms