Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDGFDQ9GZP0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms