Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms