Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A9Q96Q91 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms