Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP53Q96M91 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms