Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM47Q96LD4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms