Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4CQ96DT6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms