Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PRG4Q92954 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms