Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC6Q8IVU3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms