Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP1Q86WV1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms