Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms