Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREML4Q6UXN2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms