Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOCADQ5VW36 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms