Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PERM1Q5SV97 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms