Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRNQ4KMQ1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms