Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC96Q2M329 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms