Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIV2LQ15477 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms