Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms