Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAD4Q13485 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
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