Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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