Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4A11Q02928 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4A11Q02928 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms