Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms