Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CDC42EP1Q00587 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC42EP1Q00587 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC42EP1Q00587 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms