Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms