Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms