Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRAP54198 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRAP54198 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRAP54198 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRAP54198 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRAP54198 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRAP54198 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRAP54198 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRAP54198 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRAP54198 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRAP54198 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRAP54198 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRAP54198 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRAP54198 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRAP54198 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRAP54198 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRAP54198 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRAP54198 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRAP54198 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HIRAP54198 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRAP54198 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRAP54198 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRAP54198 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRAP54198 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRAP54198 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRAP54198 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRAP54198 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRAP54198 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRAP54198 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRAP54198 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRAP54198 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRAP54198 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRAP54198 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRAP54198 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRAP54198 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRAP54198 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRAP54198 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRAP54198 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms