Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF6P49848 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF6P49848 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF6P49848 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF6P49848 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF6P49848 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF6P49848 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF6P49848 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF6P49848 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF6P49848 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF6P49848 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF6P49848 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF6P49848 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF6P49848 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TAF6P49848 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TAF6P49848 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TAF6P49848 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TAF6P49848 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TAF6P49848 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TAF6P49848 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TAF6P49848 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TAF6P49848 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TAF6P49848 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TAF6P49848 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF6P49848 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF6P49848 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF6P49848 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF6P49848 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF6P49848 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF6P49848 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF6P49848 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF6P49848 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF6P49848 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF6P49848 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF6P49848 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF6P49848 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF6P49848 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF6P49848 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms