Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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