Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms