Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms