Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA3AA6NCI4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms