Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

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Length 1,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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CCDC180Q9P1Z9 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC180Q9P1Z9 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC180Q9P1Z9 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC180Q9P1Z9 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC180Q9P1Z9 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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CCDC180Q9P1Z9 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC180Q9P1Z9 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC180Q9P1Z9 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC180Q9P1Z9 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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CCDC180Q9P1Z9 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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CCDC180Q9P1Z9 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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CCDC180Q9P1Z9 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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CCDC180Q9P1Z9 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC180Q9P1Z9 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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CCDC180Q9P1Z9 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC180Q9P1Z9 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC180Q9P1Z9 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC180Q9P1Z9 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC180Q9P1Z9 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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CCDC180Q9P1Z9 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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CCDC180Q9P1Z9 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC180Q9P1Z9 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC180Q9P1Z9 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC180Q9P1Z9 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC180Q9P1Z9 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC180Q9P1Z9 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC180Q9P1Z9 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
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