Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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