Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms