Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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CDO1Q16878 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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CDO1Q16878 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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CDO1Q16878 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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CDO1Q16878 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDO1Q16878 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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